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Avances en Bioquímica y Biología Molecular
Curso 2017/18
1. Datos Descriptivos de la Asignatura
ASIGNATURA: Avances en Bioquímica y Biología Molecular CÓDIGO: 209230902
- Centro: Facultad de Ciencias
- Titulación: Grado en Biología
- Plan de Estudios: 2010 (publicado en 14-01-2011)
- Rama de conocimiento: Ciencias
- Itinerario/Intensificación:
- Departamento/s: - Área/s de conocimiento:
  • Bioquímica y Biología Molecular
- Curso: 4
- Carácter: Optativa
- Duración: Cuatrimestral
- Créditos ECTS: 6.0
- Horario: http://www.ull.es/view/centros/biologia/Horarios_1/es
- Dirección web de la asignatura: http://www.campusvirtual.ull.es
- Idioma: Castellano e Inglés (0.3 ECTS en Inglés)


2. Requisitos para cursar la asignatura
Recomendados: haber superado Bioquímica 1 y Bioquímica 2


3. Profesorado que imparte la asignatura
Profesor/a Coordinador/a: NELIDA EMILIA BRITO ALAYON
- Grupo: Teoría Grupo 1, Prácticas,Problemas, Aula de informática, Seminarios y tutorías
- Departamento: Bioquímica, Microbiología, Biología Celular y Genética
- Área de conocimiento: Bioquímica y Biología Molecular
- Lugar Tutoría: Sección de Biología, Torre 3, 5º planta, Área de Bioquímica y Biología Molecular
- Horario Tutoría: Lunes, miércoles y viernes 11:30 a 13:30
- Teléfono (despacho/tutoría):
- Correo electrónico: nbrito@ull.es
- Dirección web docente: http://www.campusvirtual.ull.es
Profesor/a: JOSE MANUEL SIVERIO EXPOSITO
- Grupo: Teoría Grupo 1, Prácticas, Seminarios
- Departamento: Bioquímica, Microbiología, Biología Celular y Genética
- Área de conocimiento: Bioquímica y Biología Molecular
- Lugar Tutoría: Sección de Biología, Torre 3, 5º planta, Área de Bioquímica y Biología Molecular
- Horario Tutoría: Lunes y Miércoles: 10,30-1,30. Lugar: Área Bioquimica. Siempre pedir cita (jsiverio@ull.es), así no se producirán solapamientos con otros alumnos.
- Teléfono (despacho/tutoría): 922318406
- Correo electrónico: jsiverio@ull.es
- Dirección web docente: http://www.campusvirtual.ull.es
Profesor/a: CELEDONIO GONZALEZ DIAZ
- Grupo: Teoría Grupo 1, Problemas, Seminarios
- Departamento: Bioquímica, Microbiología, Biología Celular y Genética
- Área de conocimiento: Bioquímica y Biología Molecular
- Lugar Tutoría: Sección de Biología, Torre 3, 5º planta, Área de Bioquímica y Biología Molecular
- Horario Tutoría: Lunes, miércoles y viernes 11:30 a 13:30
- Teléfono (despacho/tutoría):
- Correo electrónico: cglez@ull.es
- Dirección web docente: http://www.campusvirtual.ull.es


4. Contextualización de la asignatura en el plan de estudio
- Bloque formativo al que pertenece la asignatura: Formación complementaria
- Perfil profesional: Profesional sanitario, Profesional de la investigación y desarrollo, Profesional de la industria, Profesional agropecuario, Profesional del medio ambiente y Profesional docente.


5. Competencias
Competencia Específica del Hacer
[CEH8] Aislar, analizar e identificar biomoléculas. Identificar y utilizar bioindicadores.
[CEH9] Evaluar actividades metabólicas.
[CEH10] Identificar y analizar material de origen biológico y sus anomalías.
[CEH11] Manipular material genético, realizar análisis genético y llevar a cabo asesoramiento genético.
[CEH13] Desarrollar y aplicar productos y procesos de microorganismos.
[CEH14] Diseñar y aplicar procesos biotecnológicos.
[CEH16] Realizar bioensayos y diagnósticos biológicos
[CEH20] Diseñar modelos de proceso biológicos.
Competencia Específica del Saber
[CES14] Replicación, transcripción, traducción y modificación del material genético.
[CES15] Vías metabólicas.
[CES16] Señalización celular.
[CES17] Bioenergética.
Competencia General
[CG1] Conocer los conceptos, métodos y resultados más importantes de las distintas ramas de la Biología, así como una perspectiva histórica de su desarrollo.
[CG2] Reunir e interpretar datos, información y resultados relevantes, obtener conclusiones y emitir informes razonados sobre problemas científicos, tecnológicos o de otros ámbitos que requieran el uso de herramientas biológicas.
[CG3] Aplicar tanto los conocimientos teóricos-prácticos adquiridos como la capacidad de análisis y de abstracción en la definición y planteamiento de problemas y en la búsqueda de sus soluciones tanto en contextos académicos como profesionales.
[CG4] Comunicar, tanto por escrito como de forma oral, conocimientos, procedimientos, resultados e ideas en Biología tanto a un público especializado como no especializado.
[CG5] Estudiar y aprender de forma autónoma, con organización de tiempo y recursos, nuevos conocimientos y técnicas en cualquier disciplina científica o tecnológica


6. Contenidos de la asignatura
Contenidos teóricos y prácticos de la asignatura
Contenidos teóricos
- Profesores Nélida Brito Alayón, Celedonio González Díaz y José Manuel Siverio Expósito
Modulo I: Técnicas básicas de purificación y análisis de proteínas (12h).
Centrifugación, cromatografía, HPLC, electroforesis convencional y capilar,
Espectrometría de masas de proteínas (ESI-TOF, MALDI-TOF,LC-MS/MS). Proteoma y huella peptídica
Técnicas isotópicas. Autorradiografía.
Técnicas inmunológicas: inmunoblot, inmunoensayos. Nanoanticuerpos.
Interacción proteína-PROTEÍNA: co- inmunoprecipitación, 2-hybrid, crosslinking, pull-down

Módulo II: Bioquímica de la señalización celular (10h).
Sistemas básicos de señalización celular: la superfamilia de receptores con siete dominios transmembrana,
señalización mediada por AMP cíclico, señalización mediada por calcio, mensajeros de origen lipídico, óxido nítrico (NO) /GMP cíclico y otros mensajeros de acción local, transducción de señales por receptores de hormonas esteroideas y tiroideas.
Bioenergética y estructura del transporte.

Módulo III: Biotecnología Bioquímica (8h).
Transcripción y biotecnología
Las enzimas como herramientas biotecnológicas. Biorreactores. Biosensores
Las células como fábricas de síntesis de compuestos.
Uso biotecnológico de virus y anticuerpos.
Ingeniería de proteínas.
Biotecnología ambiental.

Contenidos prácticos
- Profesores Nélida Brito Alayón y José Manuel Siverio Expósito
Expresión proteína heteróloga fusionada con proteína reportera (GFP/lacZ) en organismo modelo.
Purificación parcial de la proteína en estudio mediante cromatografía afinidad
Análisis de la expresión de un gen mediante lacZ/GFP como reportero mediante electroforesis y western blot.
Actividades a desarrollar en otro idioma
- Profesores: todos los profesores
- Temas: Se utilizará material de apoyo audiovisual (esquemas, imágenes y videos técnicos) en lengua inglesa, algunos seminarios serán impartidos en inglés y los alumnos deberán consultar bibliografía específica de los temas que se impartirán en las clases magistrales.


7. Metodología y volumen de trabajo del estudiante
Descripción
La mayor parte del contenido teórico será desarrollado en 30 horas de clases magistrales. Se utilizará el campus virtual como herramienta de apoyo, estando a disposición del alumnado el material expuesto en las clases, así como enlaces a diferentes videos o animaciones explicativos de algunos de los contenidos.

El contenido práctico de la asignatura se desarrollará en 20 sesiones, 15 de las cuales corresponden a clases prácticas de laboratorio, 3 a sesiones en el aula de informática y las 2 restantes a clases de problemas.

- En las prácticas de laboratorio se desarrollará un protocolo estándar para la expresión y análisis de una proteína fusionada con un reportero en un organismo modelo.

- Las sesiones en el aula de informática serán dedicadas a que el alumno se familiarice con herramientas
bioinformáticas básicas en el estudio y análisis de proteínas (comparación de secuencias, detección de dominios funcionales, secuencias señales, regiones transmembranas,…)

- En las sesiones de problemas se resolverán supuestos prácticos en los que se desarrollen los fundamentos de las distintas técnicas introducidas en la asignatura.

Las dos tutorías servirán para resolver y aclarar dudas de los contenidos desarrollados en la asignatura.

Por último, el alumno tendrá que realizar y exponer ante el resto de sus compañeros, un trabajo de un tema relacionado con los temas tratados en la asignatura. Las sesiones de seminarios servirán para la presentación oral de dichos trabajos que servirán para discutir en el aula aplicaciones de los contenidos y técnicas desarrolladas en la asignatura.


Actividades formativas en créditos ECTS, su metodología de enseñanza-aprendizaje y su relación con las competencias que debe adquirir el estudiante
Actividades formativas Horas presenciales Horas de trabajo autónomo Total Horas Relación con competencias
Clases teóricas  30.00      30  [CG1], [CES15], [CES16], [CEH13], [CEH14], [CEH20]
Clases prácticas (aula / sala de demostraciones / prácticas laboratorio)  20.00   13.00   33  [CG1], [CG2], [CG3], [CEH8], [CEH9], [CEH10], [CEH11], [CEH13], [CEH16], [CEH20]
Realización de seminarios u otras actividades complementarias  4.00      4  [CES14], [CES15], [CES17], [CEH9], [CEH10], [CEH14], [CEH20]
Realización de trabajos (individual/grupal)  1.00   10.00   11  [CG2], [CG4], [CEH9], [CEH13], [CEH20]
Estudio/preparación clases teóricas     13.00   13  [CG1], [CG5], [CES15], [CES16], [CEH13], [CEH14], [CEH20]
Estudio/preparación clases prácticas     14.00   14  [CG5]
Preparación de exámenes     40.00   40  [CG1], [CG5], [CES15], [CES16], [CEH13], [CEH14], [CEH20]
Realización de exámenes  3.00      3  [CG1], [CG3], [CES14], [CES15], [CES16], [CES17], [CEH13], [CEH14], [CEH20]
Asistencia a tutorías  2.00      2  [CG1]
Total horas  60   90   150 
Total ECTS  6 


8. Bibliografía / Recursos
Bibliografía básica
 
- Sambrook J., Russell, D. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Sprig Harbor. 
- Signal Transduction (Second Edition). Bastien D. Gomperts, IJsbrand M. Kramer and Peter E.R. Tatham. 
- Biocatalysts and Enzyme Technology. K. Buchholz, V. Kasche, U.T. Bornscheuer. WILEY-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 
Weinheim 
- Proteomics: Methods and Protocols, J. Reinders & A. Sickmann, Springer. 
- Protein Engineering and Design. Editores: Sheldon J. Park y Jennifer R. Cochran. CRC Press 
- Biochemistry Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko y Lubert Stryer Seventh edition. 
- Basic Biotechnology. Ratledge, C. & B. Kristiansen. 3ª ed Cambridge University Press 

Bibliografía complementaria
Se utilizarán revisiones que desarrollan capítulos de interés para una visión general de diversos temas de la asignatura. Los 
profesores podrán recomendar algunas referencias bibliográficas complementarias a lo largo del curso 

Otros recursos
http://www.currentprotocols.com
http://www.molecularstation.com
http://www.protocol-online.org
http://www.gelifesciences.com/webapp/wcs/stores/servlet/productById/es/GELifeSciences/28995326



9. Sistema de evaluación y calificación
Descripción
Convocatoria de enero (convocatoria ordinaria)

En la calificación final del alumno se valorarán 4 actividades evaluativas:

1.- Examen final. El examen final corresponderá al 65% de la nota y consistirá en un examen tipo test y/o de preguntas cortas (incluyendo problemas) en el que se evaluará la adquisición por parte de los alumnos de los conceptos y conocimientos correspondientes a toda la asignatura (clases magistrales, tutorías, prácticas, etc.). Será requisito imprescindible haber obtenido un mínimo de 5 sobre 10 para aprobar el examen y para poder contabilizar el resto de las pruebas evaluativas que se desarrollen en el cuatrimestre. La realización de este examen coincidirá con las fechas de la convocatoria.

2.- Realización de las prácticas y cuestionarios relacionados con las mismas. La realización de las prácticas es obligatoria e incluirá pruebas evaluativas escritas durante su desarrollo y al término de las mismas. Será requisito imprescindible para aprobar la asignatura haber obtenido un mínimo de 5 sobre 10 en estas pruebas, que en su conjunto contribuyen en un 15% a la calificación final.

3.- Exposición de un trabajo (seminarios). Obligatoriamente, los alumnos deberán elaborar y exponer un trabajo relacionado con los contenidos de la asignatura. La adecuada realización del mismo, así como la exposición pública, será calificada y contribuye en un 10% a la calificación final.

4.- Problemas, supuestos prácticos, etc. Durante el desarrollo del cuatrimestre se realizarán pruebas cortas y/o cuestionarios relacionados con los contenidos teóricos, los problemas y los contenidos desarrollados en las sesiones en el aula de informática. En su conjunto estas pruebas contribuyen en un 10% a la calificación final.

Para poder aprobar la asignatura, será requisito imprescindible obtener un 5 (sobre 10) en el examen final y en las prácticas, así como haber realizado las prácticas y el trabajo de exposición. Si el alumno no cumpliese alguno de estos requisitos pero aún así obtuviese una nota final superior a 4,5 se trasladará al acta, en caso necesario, una calificación de 4,5.

Aquellos alumnos que por razones debidamente justificadas no realicen las prácticas o el trabajo de exposición, tendrán que presentarse junto con el examen final, a las pruebas enumeradas como b) o c), respectivamente, en el apartado de “Evaluación única”.


Evaluación única:

Los alumnos tendrán que realizar las siguientes actividades evaluativas:
a) Un examen final idéntico al resto de compañeros, que contribuye en un 65% a la calificación final. Será imprescindible para poder aprobar la asignatura obtener un 5 sobre 10 en este examen.
b) Un examen escrito en el que se realizarán preguntas sobre los contenidos expuestos en los seminarios realizados durante el curso (el alumno dispondrá de todos los artículos expuestos para la realización de este examen). Será imprescindible para poder aprobar la asignatura obtener un 5 sobre 10 en este examen. En caso de superarlo, la nota obtenida supondrá un 10% de la nota final.
c) Un examen práctico en el laboratorio en el que el alumno demuestre su destreza para desarrollar un protocolo similar a los que se contemplan en el programa práctico de la asignatura, así como un examen escrito de los contenidos desarrollados en las prácticas. Será imprescindible para poder aprobar la asignatura obtener un 5 sobre 10 en cada uno de estos exámenes. En caso de superarlos, la nota obtenida supondrá un 15% de la nota final.
d) Un examen escrito de problemas y un supuesto práctico relacionado con los contenidos desarrollados en el aula de informática. La nota obtenida supondrá un 10% de la nota final.
Estas pruebas se realizarán en el orden descrito y serán eliminatorias, de manera que la superación de cada una de ellas condiciona la realización de la siguiente. En ningún caso la superación de alguna de estas pruebas permitirá conservar la nota de la misma para la siguiente convocatoria de la asignatura.


Convocatorias de junio y julio.

En estas convocatorias, el alumno podrá optar entre:

a) Presentarse a aquellas de las cuatro actividades evaluativas que no haya superado en la convocatoria ordinaria, conservando las restantes. Las características de estas pruebas, sus ponderaciones en la calificación final, los requisitos para aprobar, y la nota que se traslada al acta, serán las mismas que se han descrito para la convocatoria ordinaria. Asimismo, en el caso de no haber realizado las prácticas o el trabajo de exposición se procederá como allí se describe.

b) Presentarse al conjunto de pruebas evaluativas descritas en el apartado “Evaluación única”, siguiendo los mismos requisitos y ponderaciones allí explicados para el cálculo de la nota final.

En caso de optar por la opción b) el alumno deberá renunciar a la incorporación de las calificaciones de las pruebas superadas de la evaluación continua en la calificación final, al objeto de examinarse nuevamente de ellas en estas convocatorias extraordinarias. Esta renuncia debe de ser comunicada por escrito al profesor coordinador de la asignatura, antes del inicio del período de exámenes fijado en el calendario académico. De efectuarse, esta renuncia tendrá carácter definitivo en las restantes convocatorias de ese curso.


Estrategia Evaluativa
TIPO DE PRUEBA COMPETENCIAS CRITERIOS PONDERACIÓN
Pruebas objetivas  [CG1], [CG2], [CG3], [CEH8], [CEH9], [CEH10], [CEH11], [CEH13], [CEH16], [CEH20]   Se desarrollarán distintas pruebas objetivas a lo largo del curso
relacionadas con los contenidos teóricos, problemas y uso de
herramientas de bioinformática
 
 10% 
Trabajos y proyectos  [CG2], [CG4], [CEH9], [CEH13], [CEH20]   Se valorará el contenido y la presentación del trabajo, así como la claridad en la exposición.   10% 
Pruebas objetivas (examen final)  [CG1], [CG3], [CES14], [CES15], [CES16], [CES17], [CEH13], [CEH14], [CEH20]   La prueba se superará alcanzando una puntuación mínima de 5 sobre 10   65% 
Pruebas objetivas (examen prácticas)  [CG5]   Se valorará la correcta interpretación de los datos, realización de cálculos y estimaciones numéricas
Se valorarán los cuestionarios realizados a lo largo de las prácicas 
 15% 


10. Resultados de Aprendizaje
 
Los alumnos serán capaces de:

Llevar a cabo cualquier protocolo de aislamiento, purificación y análisis de biomoléculas, específicamente de proteínas, y de buscar alternativas para mejorar el rendimiento del protocolo propuesto.

Identificar los sistemas básicos de señalización y de valorar las posibles consecuencias en el metabolismo celular de alteraciones en los procesos de señalización.

Buscar, obtener e interpretar la información de las principales bases de datos biológicos (genómicos, transcriptómicos,proteómicos, metabolómicos y similares derivados de otros análisis masivos) y de datos bibliográficos, y usar las herramientas bioinformáticas básicas.

Diseñar procesos biotecnológicos sencillos.
 


11. Cronograma / calendario de la asignatura
Descripción
 Debido a la complejidad de realizar un único cronograma existiendo varios grupos de prácticas, seminarios y tutorías distribuidos en diferentes semanas a lo largo del cuatrimestre, el siguiente cronograma recoge la distribución de actividades sólo de uno de los citados grupos a modo orientativo (101a).

Se remite a los horarios publicados en la web y en los tablones de la facultad para consultar el calendario de la asignatura y la distribución de las diferentes actividades presenciales programadas en la asignatura
 

Primer Cuatrimestre
SEMANA Temas Actividades de
enseñanza aprendizaje
Horas
de trabajo
presencial
Horas
de trabajo
autónomo
Total
Semana 1:  Módulo 1    Desarrollo conceptos centrifugación y cromatografía.
Desarrollo conceptos electroforesis convencional y capilar. 
 2.00   3.00   5 
Semana 2:  Módulo 1   Espectrometría de masas. Proteoma y huella peptídica.
Técnicas isotópicas. Técnicas inmunológicas..
 
 4.00   3.00   7 
Semana 3:  Módulo 1   Técnicas inmunológicas.Interacción proteína-proteína
 
 3.00   2.00   5 
Semana 4:  Módulo 1   Interacción proteína-proteína
Bioquímica de la señalización celular. La superfamilia de receptores con siete dominios transmembrana,
Aula de informática: Introduccióna a las herramientas básicas en bioinformática
 
 7.00   5.00   12 
Semana 5:  Módulo 1    Bioquímica de la señalización celular. Señalización mediada por AMP cíclico,
 
 1.00   1.00   2 
Semana 6:  Módulo 1
 
 Sesión de problemas
 
 1.00   5.00   6 
Semana 7:  Módulo 1/2   Bioquímica de la señalización celular. Señalización mediada por calcio, mensajeros de origen lipídico, Óxido nítrico (NO) /GMP cíclico y otros mensajeros de acción local.
 
 3.00   3.00   6 
Semana 8:  Módulo 2   Bioquímica de la señalización celular. Señalización mediada por calcio, mensajeros de origen lipídico, Óxido nítrico (NO) /GMP cíclico y otros mensajeros de acción local.
Seminarios: exposición de los trabajos realizados por los alumnos  
 2.00   4.00   6 
Semana 9:  Módulo 2   Bioquímica de la señalización celular . Transducción de señales por receptores de hormonas esteroideas y tiroideas.
Tutoría
Práticas Desarrollo experimental de un protocolo básico de expresión y análisis de una proteína fusionada con un reportero (lacZ) en un organismo modelo 
 6.00   4.00   10 
Semana 10:  Módulo 2   Seminarios
Bioquímica de la señalización celular.
Práticas Desarrollo experimental de un protocolo básico de expresión y análisis de una proteína fusionada con un reportero (lacZ) en un organismo modelo 
 15.00   4.00   19 
Semana 11:  Módulo 2   Bioquímica de la señalización celular. Bioenergética y estructura del transporte.
Sesión de problemas
 
 2.00   4.00   6 
Semana 12:  Módulo 3   Biotecnología Bioquímica. Transcripción y biotecnología. Las enzimas como herramientas biotecnológicas.
Seminario:exposición de los trabajos realizados por los alumnos.
Cuestionario Modulo 2 
 3.00   4.00   7 
Semana 13:  Módulo 3   Biotecnología Bioquímica. Las células como fábricas de síntesis de compuestos.
Seminarios: exposición de los trabajos realizados por los alumnos
 
 1.00   2.00   3 
Semana 14:  Módulo 3   Biotecnología Bioquímica. Uso biotecnológico de virus y anticuerpos.Biotecnología ambiental
Seminario:exposición de los trabajos realizados por los alumnos.
Tutoría
Tutoría para resolver dudas Módulo 2 y 3. 
 5.00   4.00   9 
Semana 15:  Módulo 3   Biotecnología Bioquímica. Ingeniería de proteínas.
Cuestionario Modulo 3 
 2.00   2.00   4 
Semanas 16 a 18:  Módulo 3   Preparación y realización evalución   3.00   40.00   43 
Total horas 60 90 150


Fecha de última modificación: 13-11-2017
Fecha de aprobación: 20-07-2017